1. 基于卫星跟踪颈圈技术的野骆驼生境选择与迁移机制研究，国家自然科学基金委，国家自然科学基金青年科学基金，项目负责人，2019-01至2021-12。

2. 全国林业自然保护区生态旅游管理评估，国家林业局，自然保护区建设与管理项目，项目负责人，2016-01至2017-01。

3. 新疆卡拉麦里山有蹄类野生动物自然保护区综合管理评估，国家林业局，中央部门预算二级项目，项目负责人，2018-01至2018-12。

4. 戈壁熊及伴生动物多样性监测研究，商务部，技术援助课题，课题负责人，2018-01至2021-08。

5. 罗布泊野骆驼国家级自然保护区综合科学考察项目，新疆罗布泊野骆驼国家级自然保护区管理局，横向项目，项目负责人，2021-01至2021-12。

6. 自然保护地监测核查，国家林业和草原局，中央部门预算二级项目，项目负责人，2021-01至2021-12。

7. 国家公园和世界自然遗产潜力区生态系统和生物多样性科学考察，科技部，基地与人才专项，课题第2参加人，2021-11至2024-11。

8. 三江源国家公园体制试点区社会经济和生态功能协同提升技术与管理体系示范，科技部，国家重点研发计划课题，课题第4参加人，2017-07至2020-06。

代表性文章：

（1）薛亚东（第一作者），孙戈，李佳，德力格尔其木格·达瓦苏仁，阿木古郎·洛布桑金巴，李广良，秦爱丽，金崑，肖文发. 蒙古国大戈壁保护区A区戈壁棕熊及同域分布动物多样性和分布格局. 林业科学, 2024, 60(7): 95-104.

（2）Xue Yadong（第一作者）, Li Jia, Li Diqiang. The wild camel (Camelus ferus) in China: Current status and conservation implications. Journal for Nature Conservation, 2021, 60: 125979.

（3）代云川，薛亚东（共同第一作者），张云毅，李迪强. 国家公园生态系统完整性评价研究进展.生物多样性，2019, 27(1): 104-113.

（4）代云川，李迪强，刘芳，张于光，张毓，姬云瑞，薛亚东（通讯作者）.人熊冲突缓解措施研究进展-以三江源国家公园为例. 生态学报, 2019, 39(22): 8310-8318.

（5）贾恒，薛亚东（通讯作者）. 构建我国自然保护区志愿者服务体系的思考. 野生动物学报, 2018, 39(1): 203-206.

获奖：2023年“国家公园我来讲”大学生科普志愿实践活动，优秀实践团队一等奖和优秀指导教师称号；

著作：2022年，《三江源国家公园生态经济功能协同提升研究与示范》副主编，北京, 科学出版社

专利：

其它：